Chrome Event - 12/07/2010

ubuntu8.10升级openoffice 到3.0

        教程也是网上找得，首先添加源：
1，系统>系统管理>软件源
点选"第三方软件",<添加>
deb http://ppa.launchpad.net/openoffice-pkgs/ubuntu intrepid main
deb-src http://ppa.launchpad.net/openoffice-pkgs/ubuntu intrepid main
点击这里 右击另存为key文件，点击“身份验证”（Authentication）导入刚才下载的key文件

2，然后，使用菜单：
系统>系统管理>更新管理器
更新即可。

尝试一下，have fun

远程备份文件

如题，要远程备份文件，将一台机器上的文件copy到另一台机器上，我自然而然就想到了scp，但是由于文件很大，运行不是后台运行的，copy一段时候后，与主机连接中断，于是想到expect与scp结合。脚步如下

#!/usr/bin/expect -f #combine scp and expect to bakcup files spawn scp -r user@hostname:/source_director/  target_directory expect "user@hostname's password:" exec sleep 1 send "passwd\n"

但是这个要是在后台运行（通过at ＆ corn）的话，也不好使，google一下说是后台运行没有终端这一说法，于是无法读取passwd，自然而然程序就停滞在那里了。
       解决的方法是建一个key trust。

ssh-keygen -t dsa 把id_dsa.pub放到远程$HOME/.ssh/authorized_keys里 scp id_dsa.pu user@远程host:/$HOME/.ssh/authorized_key #这样的话，可以输入命令后就不用输入密码了 nohup scp -r user@hostname:/source_director/  target_directory ＆

搞定！ ^_^

Install Rgraphivz package

    I'm learning bioconductor these days, and today I came with a problem when I try to install "Rgraphviz" package using biocLite('Rgraphivz'). It generated a warning message and told me ' installation of package 'Rgraphviz' had non-zero exit status' .I download it (wget http://bioconductor.org/packages/2.3/bioc/src/contrib/Rgraphviz_1.20.3.tar.gz) and used R CMD INSTALL Rgraphviz_1.20.3.tar.gz,but it didn't work either. This time,it told me 'libgvc not found', I realized maybe some certain libs are missing,but when type sudo apt-get install libgvc, same problem occured---package not found.

    After a while,I realized may this package depend on 'graphviz' package,so I type sudo apt-get istall graphviz graphviz-dev, and then R CMD INSTALL Rgraphviz_1.20.3.tar.gz. Cheer, It works.

    Go on learning!

GOSim安装

    今天有人问我GOSim的安装，我自然而然觉得很简单，输入install.packages('GOSim')自然就可以了，因为其依赖的包会从cran上自动下载。但是由于该包依赖许多bioconductor上的包，比如GO.db，而这些是不能cran上下载到的，所以你得装全GOSim所依赖的bioconductor上的包后，才能成功安装上。正确的安装方式如下：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite()#装上默认的包，可以略去 biocLite(c('GO.db',' AnnotationDbi',' annotate',' org.Dm.eg.db',' org.Hs.eg.db',' org.Mm.eg.db',' org.Pf.plasmo.db',' org.Rn.eg.db',' org.Sc.sgd.db',' topGO')); ＃这一步大概下载100m的内容，等待吧^_^ install.packages('GOSim')

这样就可以了!

Have fun！

ubuntu用户从网页上安装软件

    没有做不到的，只有你想不到的，一般我们在ubuntu上安装软件都会选择“新立得软件管理器来安装”，或者通过命令行apt-get install来完成，现在好了，用户可以直接通过网页来安装，网址是：http://appnr.com ，可以自己去尝试一下，真牛！

这次回家

17号下午3点从哈尔滨出发，19号凌晨1：30左右达到杭州，2点从杭州出发，凌晨2:40到绍兴，3点左右到家，扮一下手指，共36个小时多，除了累还能有些什么感觉呢。
火车上人多，自然是不用说了，庆幸的是我们还能买到票，能买到有座的票！可怜苦了坐车回家的同胞了！