2009年2月25日星期三

GOSim安装

    今天有人问我GOSim的安装,我自然而然觉得很简单,输入install.packages('GOSim')自然就可以了,因为其依赖的包会从cran上自动下载。但是由于该包依赖许多bioconductor上的包,比如GO.db,而这些是不能cran上下载到的,所以你得装全GOSim所依赖的bioconductor上的包后,才能成功安装上。正确的安装方式如下:


source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()#装上默认的包,可以略去
biocLite(c('GO.db',' AnnotationDbi',' annotate',' org.Dm.eg.db',' org.Hs.eg.db',' org.Mm.eg.db',' org.Pf.plasmo.db',' org.Rn.eg.db',' org.Sc.sgd.db',' topGO')); #这一步大概下载100m的内容,等待吧^_^
install.packages('GOSim')


这样就可以了!

Have fun!

2009年2月16日星期一

ubuntu用户从网页上安装软件

    没有做不到的,只有你想不到的,一般我们在ubuntu上安装软件都会选择“新立得软件管理器来安装”,或者通过命令行apt-get install来完成,现在好了,用户可以直接通过网页来安装,网址是:http://appnr.com ,可以自己去尝试一下,真牛!